Honda ha participado en el desarrollo de una batería de iones de litio compacta que funciona como una fuente de energía complementaria en el FCX Clarity.
La batería reemplaza al condensador de alta capacidad que había en los modelos FCX anteriores y que ocupan espacio al colocarlos detrás del asiento trasero. La batería es lo suficientemente pequeña como para caber debajo del asiento trasero, y además es otro detalle que contribuye al diseño elegante del FCX Clarity.
